Прошел год после масштабной битвы Годзиллы с Механической Годзиллой, и Япония получает неожиданное требование, от которого зависит судьба Токио. Чтобы избежать новых катастроф, власти должны вернуть океану абсолютно все остатки первого нашествия Годзиллы — от костей и органических тканей до фрагментов ДНК, до последней молекулы.
